據媒體報導，台灣國際造船股份有限公司受新加坡GPO公司製造的四艘特殊重載船，第四艘因出現工程瑕疵遭GPO索賠，恐讓台船損失數十億，並指台船財務狀況將影響國造潛艦一事，台船3日晚間發布聲明表示GPO案虧損主因為延遲交船與受新冠疫情影響所衍生之成本增加，以及匯率由當初訂約之台幣兌美元匯率約32元，升至28元以下所造成的匯損。董事會亦將相關資訊送交經濟部，否認媒體報導「秘密認賠了事及經濟部可能不清楚的狀況等情事」。

台船深夜發布新聞稿指出，台船與新加坡船東簽訂半潛式甲板重貨載運輪四船建造案，係於2014年由前任董事長及總經理，基於公司經營發展予以拍板簽約。該系列船主要功能為載運海上大型鑽油平台及等設備之特殊半潛式重貨載運輪，因油價由每桶90~110美元崩跌至每桶70美元以下，海上油氣業務急遽衰退且預估短期油價回穩復甦不易，船東因此於五年前提出與台船研商延遲交船之合約修訂與商務談判。本案雖有虧損，但主要虧損原因為延遲交船與受新冠疫情影響所衍生之成本增加，以及匯率由當初訂約之台幣兌美元匯率約32元，升至28元以下所造成的匯損。所有相關修約細節與風險利弊及收支也於董事會做詳細報告與充分討論，董事會會議紀錄均依規定於會後陳送經濟部核備，並無聯合報所言秘密認賠了事及經濟部可能不清楚的狀況等情事。
 
台船進一步說明，新船建造時程約需2~5年，因市場變化，造船界經常有船東公司因財務出現問題，或經濟不景氣，船東想要棄單，調降合約金額等動作，本公司為避免棄單後雙方均重創，並基於以客為尊服務船東之精神，引導雙方朝商業溝通談判解決，創造雙贏局面仍屬正常運作方式。

台船表示，GPO系列四艘船為全世界半潛載重船的旗艦船舶，具備最高等級的海上動態定位系統、環保低排碳全電力推進系統、航行冰區船級認證、安全備援與失效分析規劃等特殊設計。此外本船榮登英國皇家造船工程師學會2018年百大重要船舶雜誌封面、榮獲2019年台灣精品獎金質獎殊榮、獲國家地理頻道關注於2018年工程大驚奇節目開始籌劃拍攝本船設計建造營運的實錄，並於2019年9月全球正式播放。

台船係股票上市公司，相關財務報告依據國際財務報告準則(IFRS)編製，並經外部會計師稽核簽證。每月財務報表及各業務收支執行進度，均按證交所與金管會規定，若有少收減損，必須於事實發現時即提列與反應，該系列的主要減損均依規定完成認列。台船公司前幾年確實因國際造船業萎縮導致財務困難，但經全體員工緊縮開支，進行業務轉型，且在市場認同及各方協助下，於今年3月完成增資。目前公司財務狀況已獲得改善。
 
台船也鄭重澄清，潛艦國造預算為專款專用，所有款項撥付均經海軍與國防部按季嚴格查核，不可能有挪用甚或短付工資等疑慮情事。
 
台灣媒體週日報導，台船承接承接新加坡GPO（GREENLAND PETROLEUM OPERATION）公司委託生產製造四艘特殊舉重船，第四艘剛命名完畢的船舶，因管理疏失出現工程瑕疵，需項船東賠償高達上億元鉅額賠償。報導指台船內部高度保密，不希望外界知道這起工程疏失造成的重大損失，由於台船正生產潛艦國造首艘原型艦，財務上出現龐大損失，是否間接影響潛艦工程，外界十分憂心。